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导弹集装箱船的最大优势，在于其能在高强度海战导致双方主力舰艇严重损耗后，迅速填补海上武力真空期的作战能力空白。现代驱逐舰、护卫舰造价高昂、建造周期长（3–5年），一旦在冲突初期大规模损失，短期内难以补充。而大型商船数量庞大、建造迅速（中国年产能超千艘），只需加装模块化导弹集装箱，即可在数周内转化为具备远程打击能力的“准作战平台”。这些船只虽防护弱、机动差，但在军舰稀缺的真空窗口期，足以执行区域拒止、航道封锁或饱和攻击等任务，形成“有总比没有强”的即时威慑。更重要的是，其外形与普通货轮无异，可混迹全球航运流中隐蔽部署，迫使对手在资源有限的情况下分散侦察与打击力量，极大提升战场不确定性。因此，导弹集装箱船并非替代军舰，而是作为战时应急火力补充手段，在决定胜负的关键过渡阶段，维持己方海上存在与打击能力，打乱敌方节奏——这才是其真正的战略价值所在。